9月2日,我院与巴基斯坦里法赫国际大学(Riphah International University)合作完成的研究成果"Lesion-specific oral microbiome signatures and predicted carcinogenic pathways in oral squamous cell carcinoma: a paired-site study in Pakistan"在国际期刊《Journal of Oral Microbiology》(JCR1区,IF:6.7)正式发表。该研究采用病灶—对侧配对设计,首次系统解析了巴基斯坦口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者的病灶特异性微生物组特征及其预测致癌通路。
口腔鳞状细胞癌(OSCC)是全球第七大常见恶性肿瘤,因缺乏早期诊断标志物,五年生存率仅50-60%。而口腔微生物组凭借无创采样和低成本优势,有望成为该病早期筛查的新型诊断工具。巴基斯坦是OSCC最高发的区域之一,但长期缺乏系统的口腔微生物组数据,直接影响着当地患者的早期预警和治疗策略。
此前,我院免疫所郑华军团队已与上海市第九人民医院、山东省立医院合作,开展了多项关于OSCC患者口腔菌群特征的研究。基于这些前期积累,2024年巴基斯坦里法赫国际大学的Hafiz博士主动联系郑华军研究员,表达了合作开展巴基斯坦OSCC人群口腔菌群研究的意向。经过多轮深入讨论,双方明确了分工与具体实施方案:Hafiz博士团队负责当地患者的招募、临床样本采集及流行病学背景资料的收集;我院团队则负责提供覆盖“采样—测序—分析”全链条的中国技术方案,具体包括采用国产采样拭子和DNA提取试剂盒进行样本前处理,依托我院与深圳赛陆合作搭建的Salus Pro测序平台完成2×300 bp双端测序,并利用我院自建的微生物组学分析平台开展数据挖掘。
经过细致分析,双方团队发现巴基斯坦OSCC患者病灶与对侧黏膜及健康对照的微生物群落结构存在显著差异:病灶部位显著富集 Selenomonas infelix、Treponema vincentii、Capnocytophaga leadbetteri 等7种促炎/促癌菌,而 Streptococcus oralis、Streptococcus mitis 等健康共生菌明显减少,揭示病灶存在空间特异性的微生态失衡。机器学习模型则筛选出 Peptostreptococcus stomatis(AUC = 0.971)和 Haemophilus sputorum(AUC = 0.908)等候选诊断标志物,为无创筛查提供了潜在靶标。
本研究是中国-巴基斯坦生物医学深度合作的典型案例,首次为巴基斯坦OSCC患者建立了系统性的口腔微生物组基线数据,补充了南亚高负担地区长期不足的研究数据。我院职工王玥珠、张铧月在实验设计与数据分析中发挥了核心作用,也为"中国技术+本地队列"的国际合作提供了有益示范。
