1月14日，我院召开2025年度领导班子和领导干部（绩效）考核会。市科委副主任、一级巡视员朱启高同志，市科技工作党委组织人事处陆沉同志出席会议。会议由院长、党委副书记赵健主持。院党委书记刘海峰代表院领导班子作2025年度工作报告。报告指出，一年来，生研院领导班子在市科技两委及上科院的坚强领导下，坚持科技创新和制度创新双轮驱动，围绕打造生物医药领域基石性机构和功能性平台发展目标，坚持和加强党对科技事业的全面领导，牢牢把握正确政治方向，进一步提升党建引领力；着力提升科研创新能力、技术服务能力和成果转移转化能力，加强科研条件保障及学术交流和科普工作，进一步增强核心竞争力；深入推进国家和本市4项改革试点任务，着力改进和完善体制机制，进一步释放制度生命力；持续创新完善人才“引育管用”机制，大力加强年轻人才干部锻炼培养，提升人才服务效能，进一步提高人才驱动力。会上，院领导班子成员分别进行述职。朱启高同志对生研院2025年度工作表示高度肯定，他指出，市科技两委将一如既往支持生研院的创新发展，同时对生研院提出三方面要求：一是要坚定信心、奋力再跳，以“时不我待、只争朝夕”的紧迫感，攻坚克难、勇毅前行；二是要对标先进、守正创新，立足时代发展大势，探索创新发展路径，主动谋篇布局，培育新的发展机遇与创新增长点；三是要凝心聚力、奋勇争先，领导班子成员带头示范引领全院干部职工团结向上、追求卓越。院领导班子成员、副处级及以上干部、研究所负责同志、党支部书记、工青妇主要负责同志及职代会正式代表等50余人参加会议，并对2025年度生研院领导班子和领导干部工作进行了民主测评。

2026年1月9日，2025年度上海生研院支部书记抓基层党建工作述职评议考核会在老沪闵路院区多功能厅召开。院党委书记刘海峰出席会议并作总结讲话，院长、党委副书记赵健主持会议。市科技工作党委有关同志到会指导。会上，职能部门党支部、基因所党支部、免疫所党支部、公卫所党支部、药械所党支部、生育所党支部、医院党支部7位支部书记依次进行现场述职。各支部对口联系的院领导结合分管领域党建工作实际，逐一作了针对性点评。市科技工作党委组人处陆沉同志对述职情况进行了集中点评。她充分肯定了生研院各党支部在2025年度的工作成绩，希望下一步工作进一步提升政治站位，深入领会习近平新时代中国特色社会主义思想的核心要义；进一步聚焦主责主业，围绕生研院改革发展大局谋划党建工作，推动党建与科技创新、成果转化深度融合；进一步统筹推进基层党建、干部人才队伍建设与学术交流，形成互促共进的良好局面。最后，刘海峰在总结讲话中指出，过去一年，各支部紧紧围绕生研院中心工作和科研创新实际，在强化思想理论武装、夯实组织基础、推动党建与业务融合、加强党员队伍建设等方面取得了积极成效。对下一步的工作他要求：一是要进一步强化学习领会和贯彻落实，切实把思想和行动统一到中央和本市的决策部署上来；二是要进一步强化担当作为，坚持立足科技创新使命，不断增强知责于心、担责于身、履责于行的责任感和自觉性；三是要进一步强化党建引领和保障，聚焦主责主业谋划部署党建工作，促进党建和业务工作深度融合、同频共振；四是要进一步强化全面从严治党，加强纪律建设，加强共享共治，切实强化执行力，提高工作的质量和效率。院领导班子成员、各支部书记及委员、各部门（单位）及研究所负责人、工青妇组织负责人以及院“两代表一委员”等参加会议。部分与会人员对支部书记抓基层党建工作情况进行了民主评议。

生物医药是“上海制造”的战略高地，然而核心仪器设备的国产化长期以来都是产业界亟待攻克的难题。在基因测序领域，上游设备和试剂曾被国际巨头垄断，成为制约我国生命科学发展的“卡脖子” 问题。这一状况不仅是全国生命科学界的痛点，也让作为国内基因测序主要市场之一的上海，在核心设备研发生产环节面临短板。作为由原上海市计划生育科学研究所、上海人类基因组研究中心和上海生物信息技术研究中心重组而成的科研机构，上海市生物医药技术研究院（以下简称“我院”）肩负着服务国家重大战略需求和上海生物医药产业发展的使命。我院依托国家级基因组学平台的优势，探索出全新的、体系化的产学研合作模式，主动对接国内优秀科创企业，通过合作共建“联合实验室”的模式，为国产高端仪器提供“试验田” 和 “应用场”，打通从基础研究到产品应用的转化链条。这一“主动对接企业，合作共建实验室，推动高端仪器设备实现完全自主可控的国产化替代”的工作模式，也因在推动产业发展、助力科创策源方面的创新实践，被纳入上海科学院第二期创新案例集。慧眼识珠，争做国产化的“第一用户”我院的前身之一上海人类基因组研究中心（国家人类基因组南方研究中心），自 1998 年成立起便以“国家队”身份参与了国际人类基因组计划（HGP）的中国部分和国际人类基因组单体型图计划（HapMap）的 10% 任务。二十余年的深耕，让我院在全国基因组学领域占据重要地位。但长期以来，支撑顶尖研究的高端测序仪器几乎全部依赖进口，这一现实让我们深知，国产高端测序仪器的崛起迫在眉睫。随着国内科技的发展，一批硬科技初创企业瞄准基因测序设备这一 “无人区”，试图以自主创新实现突破。成都今是科技有限公司开创性推出“单碱基纳米孔测序”技术，融合“边合成边测序”与“纳米孔检测”，突破传统技术准确率瓶颈，核心指标全面超越进口设备；深圳赛陆医疗科技有限公司凭借光学成像领域深厚积累，自主设计的测序仪光学系统视野更广、边缘清晰度更高，测序速度大幅提升，且能一机多用满足多样化场景需求。我院感染与免疫研究所副所长郑华军研究员敏锐察觉到这些企业的潜力。同时也意识到，要赋能这些初创企业更好发展，产品性能需要在实践中不断打磨。于是在他的推动下，我院迅速将今是科技、赛陆等企业的国产设备引入院内，与进口设备“真刀真枪”比拼，并持续反馈专业意见助力产品迭代。今是科技创始人兼 CEO 苏云鹏博士回忆，公司首台对外提供的工程样机便交付我院实测，我院团队每天至少三次开机测试，及时反馈操作痛点、数据偏差和功能需求。这些一线反馈成为企业产品迭代的宝贵资源，短短两年间，该工程样机就迭代为准确率媲美测序金标准的成熟产品，今年首个正式商业化年度便斩获超 3000 万元销售订单。并肩创新，联合实验室产出全新方案在基因测序产业的下半场，核心竞争力已不仅是设备硬件性能，更在于能否提供整套疾病检测解决方案。我院深刻认识到，必须超越传统“项目委托”式合作，构建“科研 - 产业 - 临床”合作闭环。目前，我院已与近 10 家企业建立联合实验室，形成微型产业创新集群。2022 年，我院推出《联合实验室管理办法》，将产业合作从“项目层面”提升至“平台层面”，以“联合实验室”这一创新机制，与合作企业升级为更稳定、深入的“创新合伙体”。联合实验室并非虚体，而是拥有固定合作期限（通常为三年）、独立账号和明确考核指标的实体化运行平台。作为国家级平台，我院在基因组学研究、基因测序技术服务方面积累了强大的技术实力、丰富的应用经验、广泛的下游客户群体和良好的行业口碑。通过联合实验室模式，我们将这些优势赋能企业，在产品研发、市场开拓、人才培养等方面形成合力。实验室管理人员由双方共同任命，每年复盘进展，我们与企业不再是简单的甲乙方关系，而是为共同目标并肩作战的伙伴。今是科技与我院的联合实验室，已将合作提升至知识产权共创层面。我院兼具“用”与“研”双重角色：“用”是基于今是科技测序平台开展应用项目，解决临床及科研实际问题；“研”则是根据国家战略和市场需求，研发样本制备试剂盒和下游分析软件，提供完整解决方案。例如，针对复杂遗传疾病确诊难题，双方合作开发了 PKD1 基因长片段测序试剂盒，形成“仪器 + 试剂 + 分析方法”的完整方案；在感染与免疫领域，正联合研发脓毒血症、肠道病原体、HIV 等一系列应用方案。赛陆在多次接洽合作后，也决定与我院共建联合实验室。我院、赛陆与广西科学院合作申请的联合实验室项目已获批，未来这里将成为赛陆产品进军东南亚市场、服务“一带一路”沿线国家的战略门户，助力国产仪器高质量“出海”。产业链赋能，助推上海基因测序产业生态成型在我院的积极推动下，曾被视为基因测序仪器设备产业“空白地”的上海，正发生着显著变化。赛陆创始人、CEO 赵陆洋博士坦言，与我院的深度合作让企业深切感受到上海在生物医药产业生态、人才资源和市场辐射方面的独特优势，更坚定了合作信心。如今，赛陆已在上海宝山投资建设生产基地，设立营销中心，完成从“技术合作”到“产业布局”的关键跨越。其 Pro 基因测序仪、Nimbo 基因测序仪核心部件自研国产、核心原料全部自产，上市一年多的 Pro 基因测序仪全国装机逾 500 台，成为国产二代测序仪中装机增速最快的品牌之一。2025年12月15日Nimbo 基因测序仪获得NMPA颁发的第三类医疗器械注册证，成为第一款由上海生产制造、面向全球的高通量基因测序仪，未来可应用于医院、疾控、海关、司法等多个场景。发源于成都的今是科技，在与我院深度合作后也进行了战略调整。由于超过 50% 的客户集中在长三角，且芯片流片业务已落地上海，企业计划将芯片流片和封测等核心环节进一步扎根上海。这种成都-上海双城联动格局，既稳固了核心研发资源，又借力长三角高精尖技术平台和广阔市场，驱动企业高速发展。目前，今是科技已推出 G-seq500、G-seq1M 等系列测序仪，测序准确率媲美金标准，芯片可稳定复用 10 次，开机成本极低，且操作高度自动化，最快 1.5 小时即可完成测序，主打去中心化应用场景。“未来的竞争，是生态的竞争。” 赵陆洋博士的观点，恰是我院搭建合作平台的初衷。我们将顶尖科研需求、企业技术创新、市场真实应用无缝衔接，这种紧密互动成为最强劲的创新催化剂。更名重组后的我院，通过体系化、开放式、务实性的合作模式，成功将自身高端技术平台能力，转化为面向产业的服务能力和孵化能力。未来，我院将继续深耕产学研合作，助力更多国产高端仪器崛起，推动上海基因测序产业生态持续完善，为国家生物医药产业发展贡献更大力量。

近日，上海市中医药大学附属光华医院联合我院在美国风湿病学会官方期刊《Arthritis Rheumatology》杂志 (中科院一区TOP，IF=10.9) 发表题为Plasma Proteomics Identifies TAOK3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target的研究论文，发现了治疗类风湿关节炎新的潜在靶点——千丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶3（TAOK3）。上海中医药大学附属光华医院2022届博士研究生辛鹏飞、复旦大学上海市生物医药技术研究院2024级博士研究生李文振、上海中医药大学附属光华医院2023届博士研究生阿欣雨和副主任医师沈军博士为论文的共同第一作者。上海中医药大学附属光华医院肖涟波教授、复旦大学上海市生物医药技术研究院谢鹭研究员、中国科学院上海免疫与感染研究所张晓明教授为本文的共同通讯作者。类风湿关节炎（RA）所致的进行性骨破坏是导致患者残疾的关键因素，其精准监测与防治是临床面临的重大挑战。目前，临床缺乏能够精准反映骨破坏状态及预测疾病复发的血液生物标志物，且现有指标多依赖炎症活动度，与骨破坏的直接关联有限，制约了治疗策略的优化。研究使用了一个整合蛋白质组学驱动的骨破坏相关靶点发现策略。该策略首先通过数据非依赖采集（DIA）质谱技术对大队列血浆样本进行深度蛋白质组定量，结合影像学Sharp评分进行相关性筛选；进而创新性地整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，将血浆中发现的候选蛋白与滑膜组织中介导骨破坏的关键细胞——成纤维样滑膜细胞（FLS）的转录组进行交叉验证，实现了系统性循环标志物与局部病变细胞的精准关联。分析团队同时应用随机森林机器学习模型对候选生物标志物进行重要性评估与组合效能优化。研究发现，丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 TAOK3 在活动期RA患者血浆及滑膜破坏性FLS中均特异性高表达，且其水平与骨破坏评分及复发频率显著相关。TAOK3联合传统标志物CRP，可将活动期RA的诊断准确率（AUC）提升至0.915，显著优于单一指标。随后的功能实验验证了该生物信息学发现的转化潜力。敲低TAOK3能有效抑制RA-FLS的类肿瘤增殖、迁移侵袭能力及基质金属蛋白酶（MMPs）表达。在胶原诱导性关节炎（CIA）小鼠模型中，靶向抑制TAOK3可显著缓解关节炎症与骨破坏。该研究展示了“血浆蛋白质组学-单细胞转录组-机器学习”多模态数据整合框架在发现疾病关键靶点方面的强大优势。其核心创新在于：① 突破单一组学局限，通过跨层次数据关联锁定高置信度靶点；② 利用机器学习量化并优化生物标志物的组合诊断价值；③ 将生物信息学发现无缝衔接至体内外功能验证，贯通了从计算发现到机制验证的完整研究链条。该策略为RA骨破坏的精准监测与靶向治疗提供了新的生物标志物和干预思路，也为其他疾病的分子靶点挖掘提供了方法学参考。原文链接：https://acrjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/art.70020

12月24日，生研院召开会议传达学习十二届市委八次全会精神。会上，院党委书记刘海峰传达了十二届市委八次全会和陈吉宁书记讲话精神及市科技工作党委有关精神并就学习贯彻落实全会精神、做好下阶段工作提出要求。院长、党委副书记赵健传达市委全会审议通过的《中共上海市委关于制定上海市国民经济和社会发展第十五个五年规划的建议》精神。会议指出，一是要认真做好学习贯彻。要把学习宣传贯彻全会精神作为当前和今后一个时期的首要政治任务，院党委、各党支部要迅速响应，通过中心组学习、专题研讨、支部学习等形式，组织党员、干部、统战人士开展系统学习，领会精神。二是要把工作落实落细。作为基层科研单位，我们要聚焦主责主业，抓年度重点任务落实、抓党建业务融合、抓全面从严治党责任，不断释放活力、激发潜能。三是要做好年末岁初工作。抓好今年和“十四五”规划工作的收官，及来年和“十五五”规划的谋划和准备，坚持安全与稳定并重、改革与发展并举，推动各项工作平稳有序开展。院领导班子成员、党的职能部门负责同志、支部书记参加会议。

12月15日，我院自主研发的1.1类中药创新药“知柏清凉颗粒”获国家药品监督管理局颁发的药物临床试验批准（通知书：2025LP03380）。该药系我院在中药创新药领域首次获批临床试验，在我院创新药物研发历程中实现一次关键跨越。其源于复旦大学附属华东医院临床经验方，由我院药械所生物分析测试组（质谱技术开发平台）团队历经长期实践积累研究而成，此药具有清热利湿、益气扶正之功效，用于治疗湿热潴留、正气衰败所致的慢性肾小球肾炎（膜性肾病）蛋白尿，具有显著功效。作为我院首个中药创新药研发，本品不仅是中医药传承创新的具体成果，也为后续系列新药研发奠定了坚实基础。该项目获得上海市科委“生物医药科技支撑专项”及我院“科技成果转化验证类项目暨省部级科研基地创新能力专项”的滚动资助。慢性肾病是全球重大公共卫生挑战，若未能有效控制，病情可持续进展，最终发展为终末期肾衰竭，需依赖透析或肾移植等替代治疗。目前我国患病率达8.2%，尿蛋白检出率为6.7%，疾病负担日益沉重。当前治疗仍存在疗效不足与副作用等局限。“知柏清凉颗粒”成功获批临床试验，有望为慢性肾病患者提供新的中医药治疗方案，更有望通过早期干预延缓疾病进展，降低终末期肾衰风险，减轻患者与社会的医疗负担。后续，我院将继续与复旦大学附属华东医院合作推进以安慰剂为对照的随机、双盲、多中心Ⅱ期临床试验，旨在评价本品用于治疗膜性肾病湿热证患者的有效性和安全性。

12月15日，上海市生物医药技术研究院自主研发的2.2类改良型新药“注射用左炔诺孕酮微球”获国家药品监督管理局颁发的药物临床试验批准通知书（通知书：2025LP03384）。该药标志着我国在长效避孕技术领域取得重大突破，有望为全球女性健康提供一项创新选择。“注射用左炔诺孕酮微球”是一种以可生物降解聚合物为载体的长效缓释微球制剂，由我院药械所药物制剂研究组团队研发。临用前将微球混悬于助悬剂中，使用普通注射器与0.6mm细针头即可完成皮下注射。单次注射后可维持6-7个月的有效避孕，载体在完成药物释放完成后在体内降解，无需手术取出。与现有长效避孕手段相比，该产品具有显著临床优势： 注射体验更优：相比需手术植入和取出的硅胶埋植剂，本品仅需常规皮下注射，针头更细、疼痛轻、创伤小，减轻患者心理负担； 免于二次手术：生物降解特性避免取出手术及相关并发症，提升安全性与依从性； 操作简便、可及性高：普通医护人员即可完成注射，适于基层医疗、流产后即时避孕等场景； 填补周期空白：目前市场上长效避孕方法多覆盖1-3个月或3-5年，本品提供的6-7个月周期精准契合流产后关爱（PAC）、2胎/3胎生育间隔调控等临床需求，助力降低重复流产风险，保护女性生育力。研发得到美国盖茨基金会调研未被满足的女性需求，全球招标后立项资助；在四个国际中标项目中，上海市生物医药技术研究院是唯一的非美国本土机构，并于概念验证阶段结题后，凭借扎实的数据成为唯一获得滚动资助的项目。此后，项目陆续获得上海张江平台项目、上海市科委择优项目等支持，持续推进关键技术攻关与平台建设。目前，相关核心专利已同步提交PCT国际专利申请及中国发明专利，为产品全球化推广奠定基础。我院已建立长效缓控释制剂、透皮和透黏膜制剂、脂质纳米制剂、智能制备共性技术平台。具备覆盖从处方前研究到完整的临床前药学研究（包括处方工艺开发、工艺放大与质量研究）的全流程开发能力，其中缓控释技术及研发能力达国际先进水平。此次获批临床试验，是“注射用左炔诺孕酮微球”走向产业化的重要一步；本产品成功转化后，将有望快速进入全球市场，并计划与盖茨基金会、克林顿健康倡议组织等国际机构合作，提升在中低收入国家及“一带一路”地区的可及性，助力全球生殖健康与家庭发展。

近日，《Chemico-Biological Interactions》（中科院1区，IF:5.4）在线发表了我院的研究成果。文章题为 “Trimethylamine N-oxide induced cognitive impairment through disruption of blood-brain barrier by inhibiting TGF-β pathway”。我院硕士研究生刘月（复旦大学生物化学与分子生物学专业）为第一作者，感染与免疫研究所李明杰研究实习员、郑华军研究员为通讯作者。氧化三甲胺（Trimethlylamine N-oxide, TMAO）是一种由肠道菌群代谢产生的化合物，与心血管疾病、肾脏疾病等密切相关。临床数据表明，认知障碍相关疾病（如轻度认知障碍、阿尔茨海默病等）患者血浆TMAO水平显著升高，但与认知障碍间的因果关系并未被明确。研究团队首先对C57BL/6J小鼠进行TMAO处理，通过行为学检测发现小鼠表现出显著的认知受损。伊文思蓝染色及透射电镜结果显示，小鼠脑区血脑屏障 (Brain-blood barrier, BBB)结构和功能发生显著受损；在海马体区域，BBB通透性显著增加，紧密连接蛋白（Tight junction proteins, TJs）表达下调，微血管超微结构出现异常。随后，通过人脑微血管内皮细胞（hCMEC/D3）制备体外BBB模型，发现TMAO处理后，细胞中TGF-β通路被显著抑制，同时伴随TNF、NF-κB 等多条炎症相关通路激活和氧化应激指标异常。而外源性补充激活剂TGF-β1可逆转TGF-β通路的抑制，并显著改善TJs表达下调和BBB功能受损。该研究明确TMAO可导致小鼠出现显著的认知功能障碍，系统揭示了 “TMAO下调TGF-β通路→破坏BBB完整性→诱导认知损伤” 的分子机制，也阐明激活TGF-β通路可能是对抗TMAO神经毒性的潜在治疗策略，为相关疾病的防治提供了新的潜在干预方向。原文链接：https://doi.org/10.1016/j.cbi.2025.111862

近日，我院 “名师大讲坛” 第四期学术活动在斜土路院区成功举办。本期活动由感染与免疫研究所、科研与研究生管理部及上海市疾病与健康基因组学重点实验室联合主办，聚焦“感染与免疫”，共探“全健康”前沿，深入探讨了“宿主健康—微生物—蚊虫媒介”的复杂互动关系，旨在为公共卫生与疾病防控研究开辟新视角。活动由免疫所副所长郑华军主持，院长赵健、副院长王健、王涤松及学委会主任傅大煦出席活动。上海交通大学医学院姚玉峰教授率先作《蛋白质翻译后修饰与病原菌致病》专题报告。作为上海市免疫学研究所 PI，姚教授长期深耕病原菌致病机制与宿主天然免疫研究。报告以沙门氏菌为研究切入点，系统阐释了蛋白质翻译后修饰在病原菌致病过程中的核心调控作用，提出蛋白翻译后修饰不仅与病原细菌存在适应性进化关联，而且也可以作为开发新型抗感染手段的重要靶点随后，复旦大学营养研究院院长、二级教授高翔带来《睡眠、膳食与健康长寿》主题分享。作为营养流行病学与衰老研究领域的专家，高教授基于多项横断面与前瞻性研究数据，系统阐述了睡眠、饮食习惯与衰老之间的关联。他的研究揭示，睡眠和膳食与免疫稳态、代谢健康及长寿密切相关，不仅为促进健康衰老提供了坚实的理论依据，也为维持机体防御能力和整体健康奠定了重要基础。中国科学院分子植物科学卓越创新中心的王四宝研究员带来题为《肠道菌“治蚊防病”的机制与应用探索》的学术报告。作为新基石研究员与中国昆虫学会副理事长，他长期致力于蚊虫与微生物互作的分子机制研究。报告中，他紧扣疟疾防控这一核心需求，揭示了蚊虫肠道共生菌能通过激活宿主免疫来抑制疟原虫发育的关键机制；并进一步介绍了如何通过基因技术改造共生菌，使其在蚊虫肠道内持续表达抗疟效应分子，从而显著阻控疟疾传播。这项研究为该领域的防控技术研发提供了坚实的理论依据与成功案例。互动交流环节，近 60 名参会科研人员、研究生踊跃提问，与三位专家展开深度探讨，现场学术氛围浓厚。赵健、傅大煦、王涤松代表我院向三位主讲嘉宾颁发纪念牌，感谢他们为我院学术研究与学科建设提供的无私支持。本次 “名师大讲坛” 通过搭建与顶尖科研团队领头人面对面交流的平台，不仅为全院科研人员与研究生拓宽了研究视野，更有效推动了学科交叉融合与科研创新活力提升，助力我院高水平学术平台建设。

11月13日，生研院党委与科管院党委开展党委理论学习中心组联组学习扩大会，深入学习党的二十届四中全会精神。会议邀请科管院教学研究部于博研究员作《绘蓝图、固根基、强科技--在接续奋斗中谱写中国式现代化新篇章》专题辅导报告，并结合工作实际和个人体会进行了深入的交流研讨。与会双方一致认为，要把深入学习领会贯彻落实党的二十届四中全会精神作为当前和今后一个阶段的首要政治任务，要坚决围绕中央、市委和上级战略部署，聚焦各自主责主业，坚持突出“科”与“实”，干字当头、奋力一跳，努力为加快国际科创中心建设做出积极贡献。作为科技研发和转化机构的生研院，与作为智库和教育机构的科管院携手开展本次联组学习是积极响应市委号召，探索深入运用“四联”工作机制，强化党建引领，促进党建与业务深度融合的一项生动实践。双方将以此次联组学习为基础和契机，进一步深化和拓展科研与教育结合方面的合作共建，促进实现高质量发展。生研院与科管院党委理论学习中心组成员、党的部门及有关支部相关人员50余人参加了本次学习。