一、技术名称

真核转录组测序

二、应用领域

1. 基因表达调控与功能解析：通过分析特定组织或细胞在不同状态下的基因表达谱，揭示基因结构、功能及可变剪接机制，支持生物生长发育调控、逆境胁迫适应等基础研究。

2. 比较与进化研究：用于比较转录组学和互做转录组学，解析物种间的基因表达差异及进化规律。

3. 疾病机制探索：通过差异基因表达（DGE）分析，筛选疾病相关基因，揭示疾病发生发展机制（如癌症、免疫相关疾病）。

4. 诊断与治疗：识别疾病标志物，辅助临床诊断及药物靶点发现，支持个性化治疗研究。

5. 作物改良与抗逆性研究：分析植物在不同环境下的转录组变化，挖掘与抗逆性、优良性状相关的基因，推动农业育种。

6. 生态适应性研究：通过环境转录组学解析生物对环境变化的响应机制。

三、技术简介

真核生物转录组测序可分为mRNA测序和long non-coding RNA（lncRNA）测序；根据有无参考序列，mRNA测序又分RNAseq（有参考序列，研究已知基因的表达丰度）和全长mRNA测序（无参考序列，需对编码基因进行预测和注释）。全长mRNA测序不仅可帮助基因组拼装后的精确注释，更可以对未知基因组的物种进行基因功能研究。

四、技术优势

可以基于微量RNA（低至1ng total RNA）进行cDNA文库构建和测序；同时利用Pacbio三代测序，可以获得全长cDNA序列。

五、相关图片

六、典型案例

先后完成了包括水稻、藏酋猴、涡虫、火龙果、红豆杉等物种的全长mRNA测序。

七、联系人、联系电话、邮箱

金老师，13817707367，jinl@chgc.sh.cn