一、技术名称
m6A RNA甲基化测序(MeRIP-Seq)
二、应用领域
1. 疾病机制研究:解析癌症、神经退行性疾病(如阿尔茨海默症)、胚胎发育异常等与m6A修饰异常相关的病理机制。
2. RNA功能调控:揭示m6A在mRNA稳定性、剪接、翻译及miRNA加工中的作用网络。
3. 靶向治疗开发:筛选m6A甲基化酶(如METTL3)或去甲基化酶(如FTO、ALKBH5)的药物靶点。
三、技术简介
MeRIP-Seq(甲基化RNA免疫沉淀测序)是一种基于抗体富集和高通量测序的RNA甲基化检测技术,用于全转录组水平m6A修饰位点鉴定。其核心流程包括:(1)RNA免疫沉淀:采用特异性m6A抗体与片段化RNA结合,富集甲基化修饰区域;(2)文库构建与测序:富集RNA与对照(Input)样本并行建库,通过二代测序(NGS)获取数据;(3)峰值分析:通过MeRIP-seq与Input数据比对,识别m6A甲基化富集峰(如mRNA的5'UTR、3'UTR及终止密码子区)。 该技术需50 μg总RNA或等效组织/细胞样本,单样本数据量6G×2(含Input对照),可精准定位甲基化修饰位点,覆盖转录组90%以上的m6A修饰区域,灵敏度达1%修饰水平差异。
四、技术优势
1. 全转录组覆盖:无偏检测mRNA、lncRNA、circRNA等各类RNA的m6A修饰位点,支持新修饰位点发现。
2. 高分辨率与灵敏度:单碱基分辨率结合抗体富集,可识别低丰度修饰(如肿瘤微环境中的稀有RNA修饰)。
3. 功能关联性明确:直接关联m6A修饰与RNA代谢(如翻译效率、miRNA成熟)及疾病表型,指导机制验证。
4. 实验灵活性与兼容性:适配多种样本类型(组织、培养细胞、外泌体RNA),支持低至100 mg组织或10⁸细胞。
五、相关图片

六、典型案例
Chen, Z., Zhang, J., Wang, J., Tong, H., Pan, W., Ma, F., Wu, Q.*, & Dai, J*. (2024). N6-methyladenosine RNA modification promotes Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus infection. PLoS Pathogens, 20(11), e1012725.
七、联系人、联系电话、邮箱
吴老师,15618977533,henrywuqh@hotmail.com