应用领域:
1. 细菌毒力因子鉴定
通过构建大量随机突变株,筛选具有特殊表型(如致病力减弱)的突变体,定位并验证相关毒力基因。该方法在病原菌研究中具有高效、简便的优势。
2. 基因功能高通量筛选
利用转座子插入突变,结合表型筛选(如抗药性、代谢缺陷),可系统性解析细菌基因功能,尤其在代谢工程和合成生物学中应用广泛。
技术简介
Tn5转座子随机插入突变体库高通量测序技术是一种结合了转座子插入突变和高通量测序的强大功能基因组学方法13。其核心在于利用改造后的Tn5转座酶,该酶能够在体外高效实现DNA的随机片段化与接头标签添加。通过构建一个包含大量随机插入突变的菌株库,并在特定条件下培养后,利用高通量测序技术确定转座子的插入位点,从而分析基因功能及其与表型的关联。
技术优势
1. 高效性与高通量
大规模并行分析:高通量测序可同时对数百万个突变体进行测序,快速定位插入位点,显著提升筛选效率(如单次实验可覆盖全基因组数千个基因)。
2. 高分辨率与精准定位
单碱基精度:高通量测序可精确确定转座子插入位点(如±1 bp),结合生物信息学分析(如BWA、Bowtie2比对),直接关联插入位点与表型。
全基因组覆盖:通过测序数据可全面评估插入偏好性,避免传统方法(如Southern blot)的抽样偏差,确保无遗漏靶基因。
应用场景和案例:
先后完成了中国科学院北京微生物研究所大肠杆菌突变体库、复旦大学生命科学学院仓鼠细胞突变体库高通量测序。
联系人:金磊,13817707367,jinl@chgc.sh.cn
